Al parecer, WHMCS necesita usar whois...
Bueno, para que no tengas que apagar SELinux, solo:
su -c 'setsebool -P httpd_can_network_connect on'
Ésto permitirá, a apache, conectarse al puerto 43.
Nota sobre iptables
En Fedora, todas las conexiones iniciadas desde el servidor a cualquier puerto, están permitidas. No hay que agregar …